字秉之，亦字云卿。少时机警敏悟，入私塾读《论语》、《大学》皆能述其要义。出随附耕作，没伴灯读书，后外出谋生，为粮船会计，旅居京都数年，积资千金。清道光二十四年，捐资以从九品分发湖北试用。咸丰元年授沔阳州锅底司巡检，五年，以县丞试用，六年升知县。七年湖北巡抚胡林翼奏留办理膏井盐茶。八年湖广总督官文以其洁已奉公保奏以直隶州同知补用，九年奉令办理厘金牙贴盐务，胡林翼奏请以知府备用，十一年随官文收复被太平军攻占的黄州府县城，以军功破例授知府补用，同治元年（1862）持授汉阳知府，不数即调办粮台。三年，官文以其廉正勤明，核算严密，能任劳怨，奏准赏给盐运使选。四-，调任武昌知府，以功晋一级官阶，旋即升任汉黄德道，监督江汉关税。八年，两江总督曾国藩令其办理汉口淮盐局务，继而升两粤盐运使，后二年兼署按察使。十二年十一月因年老请假还乡，十三年卒于家。钟捐资重刊《阮本十三经注疏》、《通志堂经解》、《古今解汇函》、《小学汇函》，版本均存广东，左宗棠闻钟谦钧死，喟然曰：“循吏之功，大于名将”，上书清廷，陈述其生平事迹，请宣付国史，湖南巡抚亦上疏陈其义行，皆得清廷允准。清朝统治200余年，入清史循吏传者24人，钟即其一。湖北士民以钟谦钧入汉阳名宦祠享祭。